公司是可以扣除相应的工资。劳动者提出辞职的，没有按照公司规定完成公司工时，公司是可以扣除相应的工资。劳动者认为公司扣除工资金额过多的，可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
离职流程：
1、员工原则上应提前30天将书面《辞职报告》交到人事行政部，并领取离职手续表。人事行政部对离职员工进行离职面谈，了解其离职原因并做记录；
2、按照离职手续表办理相关手续 ：
(1)离职员工将离职手续表交部门负责人签字。部门主管以上岗位需经总经理签字。
(2)由离职员工所在部门的助理向离职员工收回工作证，员工手册，工作服，办公用品，确认上交无误后由助理签字确认 。
(3)由财务部检查离职员工与公司在财务上是否有拖欠(包括所借款项，出差报销 )，如有拖欠当场清还，无拖欠则由财务部在离职手续表上签字确认。
(4)离职员工在得到离职手续表上所有需要的签名后，人事行政部向员工出具"关于与__解除劳动合同的决定"。
(5)人事行政部安排人员到失业保险经办机构办理终止、解除劳动关系备案手续；凭备案审核意见，到社会保险经办机构中止职工社会保险关系；同时封存离职员工的公积金。如离职员工需要转移公积金则由人事行政部根据其所提供的新账户进行转移，如需取出则由员工自行办理。
(6)人事行政部在职工解除劳动关系之日起30日内，到失业保险经办机构办理失业保险待遇审核手续。
(7)人事行政部将离职员工的档案重新归档，同时结清工资。
法律依据：
《中华人民共和国劳动法》
第九十一条 用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。
